Das Kommando des KKE Thurgau besteht aus der Berufs- und der Milizkomponente und führt die Einheit administrativ als auch operativ.
Der Bataillonskommandant und sein Stellvertreter sowie die Stabsfunktionen S1 (Zivilschutzstelle) und S4 (Logistik) bilden das Berufskommando und sind in ihrer Hauptfunktion beim Amt für Bevölkerungsschutz und Armee in der Abteilung Zivilschutz in verschiedenen Funktion tätigt.
Die Kompaniekommandanten sowie deren Stellvertreter bilden das Milizkommando.
Team
Oberstleutnant Simon Karli
Kommandant
Hauptmann Samuel Breitler
Kommandant Stellvertreter
Hauptmann Louis Baumann
Kompaniekommandant Pionierkompanie
Hauptmann Patrick Stadelmann
Kompaniekommandant Stellvertreter Pionierkompanie
Hauptmann Raffael Buff
Kompaniekommandant Stabskompanie
Hauptmann Ramon Portmann
Kompaniekommandant Stellvertreter Stabskompanie
Hauptmann Kris Leibundgut
Kompaniekommandant ABC-Kompanie
Major Philipp Hardegger
S4, Logistikoffizier
Hauptmann Murat Koturman (QM ZS TG)
Leiter Personelles / Leiter Kurs- und Kdo - Administration